- Страх перед восстаниями рабов: Рейд Брауна рассматривался как прямая угроза институту рабства на Юге. Южане опасались, что действия Брауна вдохновят рабов на восстание и свержение своих хозяев. Эти опасения усугублялись тем фактом, что Браун специально нацелился на Харперс-Ферри, федеральный арсенал, содержащий большое количество оружия.
- Нарушение государственного суверенитета: Рейд Брауна также был расценен как нарушение государственного суверенитета. Южане считали, что федеральное правительство не имеет права вмешиваться в рабство на Юге, и рассматривали нападение Брауна как попытку сделать именно это. Это мнение было особенно сильным в Вирджинии, где находился Харперс-Ферри.
– Экономическое воздействие: Рейд Брауна также оказал значительное экономическое влияние на Юг. Уничтожение федерального арсенала в Харперс-Ферри нарушило торговлю и коммерцию, а также привело к увеличению военных расходов южных штатов. Это создало нагрузку на экономику Юга, которая и без того пыталась конкурировать с Севером.
Помимо этих конкретных причин, южане также в целом были недовольны растущим аболиционистским движением на Севере. Они считали, что аболиционисты несправедливо нападают на их образ жизни, и считали рейд Брауна кульминацией этой тенденции.
В результате рейда Брауна напряженность между Севером и Югом резко возросла. Рейд помог подтолкнуть страну к гражданской войне, которая началась всего два года спустя.