Основной функцией Белжеца было уничтожение евреев, в то время как в других лагерях также убивали цыган и синти. За время работы лагеря, с 17 марта 1942 года по 28 июня 1943 года, в газовых камерах было убито от 450 000 до 500 000 евреев, а также небольшое количество рома и синти.
Жертв сначала доставляли по железной дороге в Белжец из гетто на юге и востоке Польши, а затем также из Львовского и Станиславовского гетто. В обычный день в лагерь прибывало до 12 000 евреев, и почти все были убиты в тот же день. Убийства в Белжеце были демонтированы после того, как немецкие войска подавили восстание в Варшавском гетто весной 1943 года. Затем нацисты уничтожили улики, чтобы скрыть информацию о резне.
