Анализ древних геномов показывает, что различные ветви генеалогического древа человека многократно скрещивались и что некоторые люди несут ДНК от архаичного и неизвестного предка.
Мелисса Хубиш и Эми Уильямс из Корнелльского университета и Адам Сипель из лаборатории Колд-Спринг-Харбор сообщают об этих результатах в исследовании, опубликованном в PLOS Genetics .
Примерно 50 000 лет назад группа людей мигрировала из Африки и скрестилась с неандертальцами в Евразии. Но это не единственный раз, когда наши древние предки человека и их родственники обменивались ДНК. Секвенирование генома неандертальцев и менее известной древней группы денисовцев позволило по-новому взглянуть на эти процессы скрещивания и перемещения древних человеческих популяций.
В ходе исследования ученые разработали алгоритм анализа геномов, который может идентифицировать сегменты ДНК, принадлежащие другим видам, даже если этот поток генов произошел тысячи лет назад и произошел из неизвестного источника.
Они использовали алгоритм для изучения геномов двух неандертальцев, денисовца и двух африканских людей. Исследователи обнаружили доказательства того, что 3 процента генома неандертальцев произошли от древних людей, и, по их оценкам, скрещивание произошло между 200 000 и 300 000 лет назад.
Более того, вполне вероятно, что 1% генома денисовцев произошел от неизвестного и более дальнего родственника, возможно, Homo erectus. , и около 15% из них суперархаичные черты, которые они могли передать современным людям, живущим сегодня.
Полученные данные подтверждают ранее сообщенные случаи потока генов между древними людьми и их родственниками, а также указывают на новые случаи скрещивания.
Учитывая количество этих событий, исследователи полагают, что генетический обмен был вероятен всякий раз, когда две группы пересекались во времени и пространстве. Их новый алгоритм решает сложную проблему идентификации небольших остатков потока генов, произошедшего сотни тысяч лет назад, для которого доступна лишь горстка древних геномов. Этот алгоритм также может быть полезен для изучения потока генов у других видов, у которых имело место скрещивание, например, у волков и собак.
Что мне кажется интересным в этой работе, так это то, что она демонстрирует, что можно узнать о глубокой истории человечества, совместно реконструируя всю эволюционную историю коллекции последовательностей как современного человека, так и архаичных гомининов сказал автор Адам Сипель. Этот алгоритм способен вернуться во времени дальше, чем любой другой вычислительный метод, который он когда-либо видел. Похоже, что он особенно эффективен при обнаружении старой интрогрессии.