Введение
Анализ древних геномов показывает, что ветви человеческого родословного древа неоднократно скрещивались, и часть современных людей несёт ДНК архаичного, пока неидентифицированного предка.
Исследование
Мелисса Хубисз, Эми Уильямс (Корнелл) и Адам Сайпел (Cold Spring Harbor Laboratory) представили результаты в журнале PLOS Genetics.
Контекст
Около 50 000 лет назад группа людей покинула Африку и скрещивалась с неандертальцами в Евразии. Однако это был не единственный случай генетического обмена между нашими предками и их родственниками. Секвенирование геномов неандертальцев и менее известной группы денисовцев открыло новые детали этих взаимодействий и миграций древних популяций.
Методика
Учёные разработали алгоритм, способный выявлять в геномах участки ДНК, пришедшие от других видов, даже если поток генов произошёл тысячи лет назад и источник неизвестен.
Результаты
Применив алгоритм к геномам двух неандертальцев, одного денисовца и двух современных африканцев, исследователи обнаружили, что около 3 % генома неандертальцев происходит от древних людей; скрещивание, вероятно, имело место 200 000–300 000 лет назад.
Кроме того, примерно 1 % генома денисовцев, по их оценкам, пришёл от неизвестного более далёкого родственника, возможно, Homo erectus. Около 15 % этих «суперархаических» элементов могли быть переданы современным людям.
Значение
Полученные данные подтверждают ранее известные случаи генетического обмена между древними гоминидами и раскрывают новые примеры интрогрессии. Исследователи полагают, что обмен генетическим материалом происходил каждый раз, когда две группы встречались во времени и пространстве.
Новый алгоритм решает сложную задачу выявления небольших остатков древних потоков генов, доступных лишь в ограниченном числе древних геномов, и может быть полезен для изучения интрогрессии и в других видах, например, у волков и собак.
Комментарий автора
«Меня вдохновляет, что эта работа показывает, насколько можно узнать о глубокой истории человека, совместно восстанавливая эволюционную историю современных и архаичных гоминидов», — сказал Адам Сайпел. «Этот алгоритм позволяет заглянуть дальше во времени, чем любые другие известные методы, и особенно эффективен в обнаружении древних интрогрессий».
