Изменения окружающей среды
Одна из гипотез связывает исчезновение археамфор с радикальными изменениями среды обитания. В эдиакарском периоде климат был значительно теплее, а океаны — более кислыми, что создавало неблагоприятные условия для их выживания.
Конкуренция с другими организмами
Эдиакарский период ознаменовался бурным эволюционным ростом: появилось множество новых животных и растений. Эти новоиспечённые виды могли конкурировать с археамфорами за пищу и ресурсы, способствуя их исчезновению.
Болезни
Возможен и вариант, что эпидемии болезней быстро распространились среди популяции археамфор, приводя к массовой гибели.
Скорее всего, сочетание всех перечисленных факторов — климатические изменения, конкуренция и патогены — сыграло решающую роль в вымирании археамфор.