Его дети, от старшего до младшего:
1) Джеймс Кук (младший) (13 ноября 1763 г. - 28 декабря 1794 г.)
- Он вступил в Королевский флот в 1778 году и, как и его отец, дослужился до звания командующего. Он погиб во время экспедиции к Берингову проливу в 1794 году.
2) Натаниэль Кук (14 декабря 1764 г. - 2 октября 1781 г.)
- Он также присоединился к Королевскому флоту и служил в третьем рейсе своего отца. Он умер от туберкулеза в 1781 году в возрасте 16 лет.
3) Элизабет Кук (15 апреля 1767 г. - 13 мая 1771 г.)
- Она умерла в возрасте 4 лет и похоронена в Степни, Восточный Лондон.
4) Джозеф Кук (25 августа 1768 г. - 11 сентября 1768 г.)
- Он умер в младенчестве и тоже похоронен в Степном.
5) Сара Кук (24 апреля 1770 г. - 18 февраля 1821 г.)
- В 1792 году она вышла замуж за офицера Королевской морской пехоты по имени Джон Рикман.
6) Хью Кук (21 мая 1776 г. - 19 октября 1793 г.)
- Он поступил в Королевский флот в 1788 году и служил на нескольких кораблях, включая HMS Victory. Он умер от желтой лихорадки в 1793 году в возрасте 17 лет.