Судостроение была еще одной важной отраслью промышленности в средних колониях. Леса региона давали древесину, необходимую для строительства кораблей, а многочисленные реки и гавани облегчали транспортировку кораблей на рынок. Средние колонии строили корабли как для внутренней, так и для международной торговли.
Торговля было также важнейшим источником дохода для средних колоний. Порты региона были одними из самых загруженных в колониях, а товары со всего мира импортировались и экспортировались через средние колонии. Средние колонии также торговали с индейскими племенами региона.
