Родителями Нэнси Линкольн были Томас Линкольн-старший и Нэнси Хэнкс. Томас Линкольн скончался в 1818 году от чахотки (или туберкулеза), когда Нэнси Хэнкс было 9 лет. Нэнси Хэнкс Линкольн скончалась в 1818 году от болезни, известной как «молочная лихорадка», всего через три дня после рождения брата Нэнси Денниса, который также скончался. . В 1819 году 10-летняя Нэнси переехала жить к дяде и тете в Кентукки.