Мексиканская эпоха (1834–1846 гг.):
- После того, как мексиканское правительство секуляризовало миссию в 1834 году, земли миссии были разделены и переданы частным лицам, что привело к расселению коренных народов чумаш, которые были связаны с миссией.
- Здания миссии начали приходить в упадок из-за отсутствия технического обслуживания и заброшенности.
Американская эпоха (с 1846 г. по настоящее время):
- После приобретения Соединенными Штатами Калифорнии после американо-мексиканской войны многие из бывших земель миссии были возвращены Католической церковью посредством судебных исков и покупок.
- В 1853 году Миссия Санта-Барбара снова стала приходской церковью и действующим францисканским монастырем, поскольку католическим религиозным орденам было разрешено вернуться в Калифорнию.
- Реставрационные работы по сохранению и восстановлению зданий миссии начались в конце 19 века, а значительные реконструкции проводились на протяжении 20 века, чтобы максимально приблизить миссию к ее первоначальному виду.
- Сегодня Миссия Санта-Барбара является исторической достопримечательностью и приходской церковью и открыта для посещений, экскурсий и мероприятий.
Он действует как действующий приход в составе Архиепископии Лос-Анджелеса, а также сохраняет свое историческое значение благодаря музейным экспонатам и образовательным программам.