После войны Рикенбакер начал работать в авиационной промышленности, сначала работая руководителем в различных автомобильных и авиационных компаниях. Позже он основал собственную авиакомпанию Eastern Airlines, которая стала одной из крупнейших авиакомпаний США. Рикенбакер занимал пост президента Eastern Airlines с 1929 по 1938 год и с 1940 по 1944 год.
Во время Второй мировой войны он продолжал служить Соединенным Штатам в должности генерала ВВС США, курируя производство и закупку самолетов. Несмотря на авиакатастрофу, в результате которой он на 23 дня застрял на спасательном плоту в южной части Тихого океана, он выжил и сыграл важную роль советника генерала Генри Арнольда.
На протяжении своей послевоенной карьеры он также работал в различных правительственных комитетах и комиссиях, часто уделяя особое внимание авиации и воздушному транспорту. Он также опубликовал несколько книг о своей жизни и опыте во время войны.
Эдди Рикенбакер умер в своем доме в Цюрихе, Швейцария, 23 июля 1973 года в возрасте 82 лет. Его помнят не только как бесстрашного героя войны и пионера авиации, но и как уважаемого лидера авиационной промышленности и неутомимого изобретателя. Сторонник развития авиационной техники.