В ноябре 1948 года генералу Маркосу, как теперь называли Вафиадиса, пришлось передать руководство партизанами Никосу Захариадису, опытному воинственному коммунисту. Через месяц-два командование греческой армией принял маршал Александр Папагос, победитель Албанской кампании 1940-1941 годов.
Партизаны теперь вели безнадежную борьбу, но они могли бы продержаться в северных горах дольше, если бы президент Тито не объявил в июле 1949 года о своем намерении закрыть греко-греческую границу. Югославии и прекратить всякую помощь партизанам. Маршал Тито отделился от коммунистического блока, для него было опасно иметь враждебную нацию на своей южной границе. Поэтому он поспешил заключить союз с Афинами.
16 октября коммунисты объявили в эфире, что прекращают борьбу, чтобы спасти страну от полного разрушения.
Третий этап гражданской войны в Греции подходил к концу. Это стоило правительственным силам более 21 000 убитых и пропавших без вести и 40 000 раненых. Почти 12 000 домов было разрушено, более 4 000 мирных жителей казнены партизанами, еще тысячи, включая детей, были взяты в заложники через греческую границу. Но самые серьезные последствия этой гражданской войны были морально-психологические. Греция все еще несет на себе основную тяжесть ненависти и подозрительности, оставленных гражданской войной; оно также страдает от того, что целое поколение выросло в период, когда политическая борьба могла предложить ему только этот образ.
