Тем не менее, ACLU сыграл ключевую роль в борьбе со многими нарушениями гражданских свобод, имевшими место в эпоху «красной паники». «Красная паника», характеризующаяся повышенным страхом перед коммунистическим влиянием и паранойей по поводу потенциальных советских шпионов в Соединенных Штатах, привела к серьезным репрессиям на свободу слова, объединений и другие фундаментальные права.
В ответ на эти посягательства на конституционные права ACLU энергично защищал лиц, ставших объектами правительственных расследований, советов лояльности и расследований Конгресса в отношении предполагаемой принадлежности к коммунистам. Организация оспаривала отсутствие надлежащей правовой процедуры во многих судебных разбирательствах, выступала за признание Шестой поправки права на адвоката и выступала против проверок лояльности, которые требовали от государственных служащих отказаться от любых связей с подозреваемой коммунистической деятельностью.
Пропаганда ACLU и других групп по защите гражданских прав сыграла решающую роль в конечном итоге положить конец самым вопиющим эксцессам «красной паники» и способствовала формированию более глубокого понимания ценности защиты гражданских свобод в условиях социальных кризисов.
