Энкомендеро, испанские землевладельцы, владевшие энкомьендами, имели право требовать дань и труд от коренного населения, жившего на их земле. Индийцев заставляли работать долгие часы на полях, шахтах и в других отраслях промышленности, часто в суровых и опасных условиях. За свой труд им платили мало или вообще ничего, и они часто подвергались физическому насилию и унижениям.
Помимо физических лишений, индейцы, живущие в энкомьендах, подвергались также культурному и религиозному притеснению. Они были вынуждены принять христианство и отказаться от своих традиционных верований и обычаев. Миссионеры часто использовали принуждение и насилие для подавления религий и языков коренных народов.
Система энкомьенды была основным источником богатства для испанских колонистов, но она дорого обошлась коренному населению. Тяжелые условия и принудительный труд привели к резкому сокращению численности коренного населения, а многие общины были уничтожены болезнями, голодом и насилием.
Система энкомьенда была в конечном итоге отменена в 18 веке, но ее наследие продолжает формировать жизнь коренных народов Латинской Америки и сегодня. Эксплуатация и угнетение, которым подвергались коренные народы в период энкомьенды, оказали долгосрочное воздействие на их общины, и борьба за социальную справедливость и культурное признание продолжается и по сей день.