В средних колониях наблюдалась большая степень религиозной терпимости. Голландская реформатская церковь была официальной религией Нью-Йорка, но другим протестантским конфессиям также разрешалось свободно отправлять богослужения. В Пенсильвании, основанной Уильямом Пенном, существовала полная свобода вероисповедания. В результате Средние колонии привлекли более разнообразное население, чем Новая Англия.