После создания Пакистана Джинна стал затворником и раздражительным. Он держал в своих руках самую большую и самую маленькую власть в стране. Его военный секретарь полковник Берни записал в своем дневнике:Состояние Джинны стало похоже на ребенка, каким-то чудом нашедшего Луну, и теперь он не был готов покинуть ее ни на мгновение. .
…… Поэтому зарплата работникам, приехавшим в Пакистан после бегства из Индии, была урезана. Джинне пришлось пережить унижение, которое было позором для такого гордого человека.
…… После создания Пакистана правительство Джинны зафрахтовало у британской Overseas Air Corporation самолет, который использовался для перевозки беженцев. Правительство выдало корпорации чек на оплату, который был возвращен. Потому что на счету не было такой уж большой суммы».
В 1947 году, через неделю после приведения к присяге нового премьер-министра и кабинета министров, когда жители Пакистана отмечали первый после Рамадана праздник Ид-уль-Фитр, Джинна путем референдума сверг избранное правительство Северо-Западной пограничной провинции. Главный министр провинции доктор Хан имел значительное большинство, но Джинна сформировал там правительство своей партии.
Когда правительство, сформированное Джинной, не смогло получить вотум доверия в законодательном собрании провинции, Джинна добился ареста всех уволенных членов, и таким образом было создано искусственное большинство. Девять месяцев спустя Джинна сверг правительство провинции Синд, которое было его собственной партией. После этого Джинна попытался свергнуть во дворце правительство провинции Пенджаб.
Попытки Джинны опорочить Индию Мухаммед Али Джинна, когда-то считавшийся посланником индуистско-мусульманского единства, посвятил максимум энергии своей жизни достижению Пакистана. Он был единственным, благодаря которому образовался Пакистан, но когда Пакистан был создан, Джинна обвинил Индию в отсутствии дружественных отношений с Пакистаном. Через семь месяцев после создания Пакистана он сказал послу США в Пакистане Полу Эллингу, что он (Джинна) желает иметь такое же сотрудничество между Индией и Пакистаном, как между США и Канадой.
Пол Эллинг в своей дипломатической телеграмме, отправленной в Вашингтон, написал, что Джинна обсуждал оборонительное партнерство Пакистана с Индией на военном уровне, которое не имело четких границ. Это было бы партнерство, подобное партнерству между Соединенными Штатами и Канадой, с практически неохраняемой границей между двумя соседями, общими вооруженными силами, свободной торговлей и свободой въезда на территорию друг друга по нескольким маршрутам. Был бы.
