Согласно предложениям кабинетской миссии, лорд Уэйвелл добился формирования Временного правительства в Дели 2 сентября 1946 года. В нем участвовали только лидеры Конгресса. Джавахарлал Неру был назначен премьер-министром в этом правительстве. Также министрами были назначены Сардар Патель, доктор Раджендра Прасад, М. Асаф Али, К. Раджагопалачари, Сарат Чандра Бос, доктор Джон Матхай, Сардар Балдев Сингх, сэр Шафаат Ахмед Хан, Джагдживан Рам, Сайед Али Захир и Коведжи Хормусджи Бхабха.
Были заменены пять должностей, которые предназначались для Мусульманской лиги. Конгресс назначил трех министров-мусульман, не являющихся мусульманами, что не допускалось ни при каких обстоятельствах для Мусульманской лиги.
Джинна заявил: «Вице-король нанес огромный удар по Мусульманской лиге и мусульманам, но я уверен, что мусульмане Индии вынесут этот удар упорно и мужественно. Они извлекут урок из неудачной попытки обеспечить себе справедливое и достойное участие в этом временном правительстве.
... Это может иметь опасные и серьезные последствия. Сверху они еще больше ранили наш раненый разум, назвав имена трех мусульман. Хотя они знают, что не пользуются уважением и доверием мусульманской Индии».
1 сентября 1946 года, накануне принятия Конгрессом присяги временного правительства, Бомбей потрясли общественные беспорядки. Черные флаги начали развеваться над домами мусульман на Сандхерст-роуд. Был введен комендантский час, вызвана армия, но в результате ночного ритуала насилия 35 человек были убиты и 175 человек получили ранения. Спорадические беспорядки продолжались в Бомбее неделю. К 10 сентября погибло 200 мирных жителей. Насилие вспыхнуло и в Карачи, но призыв к миру и терпимости, переданный главным министром Лиги шейхом Гуламом Хусейном, помог мусульманам города сдержать свои эмоции.
Британский главный секретарь Синда сказал:'Из-за ужасающих событий в Калькутте одна сторона сидит с жалким недовольством, а другая является жертвой глупой паники'.
По сообщению главного секретаря, обе общины занимаются сбором разведданных. 2 сентября 1946 года Джавахарлал сформировал Временное правительство, а в послании, переданном народу страны 7 сентября, Неру сказал: «На этой древней земле было сформировано новое правительство. Мы называем это временным или временным правительством. Наша древняя и любимая земля вновь обретает свою самобытность из бед и печалей. Вновь достигнув половой зрелости, в его глазах мелькнуло мужество. Он снова поверил в себя и увидел свое предназначение».
Через несколько дней после того, как правительство было приведено к присяге, сэр Шафат Ахмед Хан, министр-немусульманин временного правительства, получил семь ножевых ранений от фанатиков Мусульманской лиги в Шимле. После неоднократных попыток Уэйвелла и удаления мусульманских министров-немусульманок из его кабинета Неру и Саратом Чандрой Босом, братом Субхаса Чандры Боса, Мусульманская лига также согласилась присоединиться к Временному правительству, чтобы правительство Конгресса могло быть обеспокоено.
Лиакат Али, И.И. Чундаригар, Абдул Раб Ништар и Джогендранатх Мандал были назначены министрами от Мусульманской лиги. Джинна сделал Джогендраната министром от имени Мусульманской лиги, вероятно, для того, чтобы Конгресс не утверждал, что он возглавляет всех индусов страны.
2 ноября члены Мусульманской лиги пришли к зданию вице-короля, чтобы предложить присоединиться к Временному правительству. Неру тоже побывал там. Его автомобиль был припаркован возле здания, и, как сообщается, мусульманская толпа подожгла его.
В этот день мусульманские лидеры, такие как Лиакат Али, пришедший для участия в Центральном Законодательном Собрании, попытались окружить машину Джавахарлала, и если бы какая-то индусская молодежь не напала на эту мусульманскую толпу, чтобы спасти Неру в то время, то Трудно сказать, что случилось с Неру. В тот же вечер в Садар-Баджаде, Дели, активисты Мусульманской лиги начали убивать индуистов, отделяя их от мусульман, останавливая транспортные средства. Против него выступили и индусы. Это привело к драке, продолжавшейся несколько часов.
