Укус змеи и зловонная рана
Во время похода к Трое Филоктет остановился на острове Лемнос, где его укусила ядовитая вода‑змея, посланная богами. Укус вызвал тяжёлую рану, из которой сочилась гнойная жидкость с резким запахом. Боль и вонь сделали героя обузой для греков, и они решили оставить его.
Проклятие Афины
По легенде Филоктета также постигло проклятие Афины. Он участвовал в краже Палладиона — деревянного изображения богини, охраняющего Трою. Когда греческие воины остановились у храма Афины в Хрисе, Неоптолем, сын Ахилла, был отправлен за статуей. Единственным, кто мог взять лук Геракла, необходимый для кражи, был Филоктет, оставшийся на Лемносе. Афина, возмущённая кощунством, отмстила, послав к нему смертельный укус змеи, после чего его оставили.
Разные версии
Существует несколько вариантов этой истории. В некоторых сказаниях решение об оставлении героя было продиктовано пророчеством о том, что только с помощью лука Геракла можно взять Трою.
Позднее Филоктет был найден и возвращён в греческую армию, где его лук сыграл решающую роль в победе над Троей.